Godzilla: La Guerra del Medio siglo, es el viaje de un hombre desde el momento en que comienza el reinado de destrucción de Godzilla y van sucediéndose, una tras otras, las batallas a lo largo de su vida.  Es el año 1954 y el teniente Ota Murakami se encuentra, por primera vez, cara a cara con Godzilla mientras este se acerca a las costas de Japón. Junto con su amigo Kentaro, y ya sin muchas opciones, Ota hace una apuesta desesperada para salvar vidas durante una cruel batalla en el corazón de Tokio. ¡Es el comienzo de una obsesión contra el Rey de los Monstruos que durará cincuenta años!